De grafkelder van Pythagoras was een relatief kleine ruimte die gemaakt was door de eerste beschaving en later werd opgenomen in de tempel van Pythagoras. Het was grotendeels leeg. Er stond alleen een kleine sokkel in het midden van de hoofdruimte op een verhoogde vloer.
Ankh • Appels uit het paradijs (#1 | #2 | #3 | #4 | #5 | Ezio's) • Kristallen bollen • Kristallen schedels • Vooruitziendheidsamulet • Fontein van de Eeuwige Jeugd • Sleutel van de Grote Tempel • Koh-i-Noor • Herinneringszegels • Profetieschijven • Voorgangerskisten • Ringen van het paradijs • Scepter van Aset • Seismische delen van het paradijs • Scherven van het paradijs • Doodskleden van het paradijs (#1 | #2) • Staven van het paradijs • Zwaarden van het paradijs (#1 | #2) • Drietand van het paradijs • Voynich-manuscript
Overige artefacten
Aegis • Mechanisme van Antikythera • Baghdad-batterij • Bloedflesjes • Het oog • IJzeren man • Sleutel van de profetieschijven • Sleutel van de tempel in Saint-Denis
Door de mens gemaakte artefacten
Pantser van Altaïr • Adelaar van Suger • Hoofd van Saint Denis • Mayaans pantser
Locaties
Het paradijs • Feyan • Het grijze • Tempels (Tempel in Alamoet | Tempel in Amritsar | Tempels in Chichen Itza | Grote Tempel | Tempel in Herat | Kerker in Jeruzalem | Observatorium | Tempel in Saint-Denis) • Romeinse kerkers (Colosseum-kerker | Grafkelder van Pythagoras | Vaticaanse kerker) • Seismische tempels (Tempel op de noordpool | Tempel in Lissabon | Tempel in Port-au-Prince)